W Katedrze wykonywane są prace badawcze z zakresu bakteriologii oraz epidemiologii. Zajmujemy się oceną potencjału chorobotwórczego drobnoustrojów. Badamy wrażliwość patogenów człowieka na leki przeciwdrobnoustrojowe, mechanizmy oporności na leki przeciwbakteryjne, leki przeciwgrzybicze i leki przeciwwirusowe. Oceniamy też działanie związków syntetycznych oraz substancji pochodzenia naturalnego pod kątem ich potencjalnej aktywności przeciwwirusowej jak też działanie na formy planktonowe i biofilm bakteryjny. Badamy też wpływ bakteriofagów na potencjał chorobotwórczy bakterii. Realizowane tematy badawcze
Bakteriologia
- Ocena fenotypowego profilu lekowrażliwości szczepów chorobotwórczych dla człowieka (bakterie tlenowe i beztlenowe oraz grzyby) izolowane z materiałów klinicznych od chorych hospitalizowanych.
- Ocena genetycznego podłoża oporności na leki przeciwdrobnoustrojowe. Poszukiwanie ruchomych elementów genetycznych oraz zlokalizowanych na chromosomie bakteryjnym. Badanie determinat oporności na makrolidy, linkozamidy, streptograminę B (mechanizm typu MLSb) gronkowców i bakterii bezltenowych w tym Clostidioides difficile. Badanie genetycznych deteminant oporności na fluorochinolony. Charakterystyka plazmidów penicylinazowych i genów beta-laktamazy u szczepów Neisseria gonorrhoeae.
- Badanie mobilnego rezystomu pałeczek z rodzaju Enterobacter.
- Badanie wirulomu rdzeniowego oraz towarzyszącego szczepów S. aureus izolowanych od pacjentów z atopowym zapaleniem skóry.
- Zastosowanie wybranych metod genetycznych (RAPD, MLVA, MLST, PCR-ribotyping, NGS) w zależności od rodzaju drobnoustrojów do różnicowania oraz analizy filogenetycznej bakterii i grzybów chorobotwórczych.
- Badanie wpływu profagów Clostridioides difficile na potencjał chorobotwórczy szczepów w szczególności wysoce wirulentnych (NAP1/BI/027) in vivo (model myszy) i in vitro.
- Synergia bakteriofag-antybiotyk – badanie interakcji bakteriofagów i różnych stężeniach antybiotyków w zwalczaniu wielolekoopornych szczepów bakterii.
- Badanie podłoża genetycznego i zdolności do wytwarzania biofilmu oraz badanie wpływu związków i substancji na formowanie biofilmu przez bakterie tlenowe i beztlenowe jak też grzyby chorobotwórcze
- Badanie aktywności przeciwbakteryjnej związków, substancji, produktów leczniczych i suplementów w tym probiotyków i prebiotyków.
- Badania epidemiologiczne zakażeń Clostridioides difficile na terenie Polski.
- Wpływ warunków stratosferycznych na przeżywalność ludzkich patogenów oraz oporność na antybiotyki.
Wirusologia
- Zakażenia wirusami u chorych w immunosupresji.
- Wirusy jako czynnik etiologiczny kardiomiopatii pozapalnych.
- Badanie wpływu bakteriofagów na przebieg zakażenia wirusowego.
- Ocena udziału białek szoku cieplnego w replikacji wirusów, rola białka opiekuńczego Hsp90 w replikacji adenowirusów, wirusa opryszczki zwykłej i wirusa Coxsackie.
- Badanie właściwości przeciwwirusowych substancji, związków oraz produktów leczniczych.
- Ocena wpływu warunków fizykochemicznych na zakaźność wirusów.
- Diagnostyka zakażeń wirusowych z wykorzystaniem klasycznych technik wirusologicznych oraz metod molekularnych: wirusowe czynniki etiologiczne zakażeń okulistycznych, wykorzystanie technik real-time PCR w diagnostyce neuroinfekcji wirusowych, wartość oznaczania profilu przeciwciał anty-EBV w ustalaniu etiologii stanów gorączkowych przebiegających z limfadenopatią, izolacja i identyfikacja wirusów opryszczki z okolicy okołogenitalnej.
- Etiologia zmian nowotworowych o lokalizacji prąciowej – określenie roli wirusów brodawczaka.
Mykologia
- Badanie zróżnicowania genetyczne klinicznych szczepów Candida spp. Molekularne podstawy patogenności grzybów
- Badania wrażliwości klinicznych szczepów Candida spp. na leki przeciwgrzybicze.
- Zastosowanie metagenomiki do identyfikacji etiologicznych czynników zakażeń u ludzi.